본원은 신학생 및 졸업생들의 선교 의식을 고취·함양하고, 선교사로서의 준비를 위한 선교 훈련 및 선교 실제 교육을 통해 선교 지원자들에게 다양한 선교 훈련을 제공한다. 

매 학기 개설되는 <선교의 실제 및 훈련>을 통해 ‘세계 선교 동향 살피기’, ‘현장 선교사들을 통한 선교지별 사역현황 파악’, ‘선교사의 실제적 삶의 훈련’ 및 선교 전략 전문가를 강사로 모시고 다양한 현대 선교 전략을 연구하고 학습한다. 

본원은 원우회 선교부와 함께 1년에 한 차례 <선교합신주간>을 주관하여 학우들의 선교 이해를 돕고 세계 선교에 대한 비전을 높이며, 졸업 후 다양한 선교 분야에서 활동할 수 있도록 선교 단체를 소개하고 선교의 구체적 방향과 비전을 제시한다.