| 년 | 월/일 | 연혁 |
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| 2023 | 02.14. | 2022학년도 제44회 졸업감사예배 및 학위수역식을 거행하다. | 2022 | 3.31. | 합신 스튜디오를 개관하다. | 4.~5. | 안상호재활의학과의원, G.M.P., 글로벌문도하우스와의 MOU를 체결하다. | 11.8. | 제34회 정암신학강좌를 개최하다. |
| 11.10. | 개교 42주년 기념 감사예배를 드리다. | |
| 2021 | 02.23. | 제11대 총장에 김학유 박사가 취임하다. |
| 5.~11. | E.S.F., 선교한국, 라이프대학교와의 MOU를 체결하다. | |
| 2020 | 02.25. | 본관과 도서관 연결통로에 건물을 증축(309㎡)하여 개관하다. | 2019 | 05.01. | 네델란드 아펠도른신학교와 Refo 500과의 MOU를 체결하다. |
| 05. - 09. | CCC., JOY선교회 등과 MOU를 체결하다. | |
| 2018 | 11.14. | 미국 퓨리탄 리폼드신학대학원과의 MOU를 체결하다. |
| 2017 | 02.21. | 제10대 총장에 정창균 박사가 취임하다. |
| 09. | 한동대학교, 아신대학교와 MOU를 체결하다. | 2015~2016 | 미국 웨스트민스터신학교와 프랑스 존 칼빈 신학교를 비롯하여 세계 유수 신학대학원 및 선교단체 등과 MOU를 체결하다. |
| 2014 | 01.28. | 목회자연장교육원을 개설하다. |
| 04.17. | Th.M. in BEP, M.A. in ICS 과정을 신설하다. | |
| 2013 | 02.26. | 제 9대 총장에 조병수 박사가 취임하다. |
| 2012 | 11.01. | 영자신학연구지 『Hapshin Theological Review』를 발간하다. |
| 2009 | 03.03. | 제 8대 총장에 성주진 박사가 취임하다. |
| 2008 | 09.09. | 본관 4층에 설교센터를 개관하다. |
| 2005 | 03.22. | 제 7대 총장에 오덕교 박사가 취임하다. |
| 2004 | 03.02. | 변화산기념도서관(건평 1,700㎥) 개관하다. |
| 2003 | 10.21. | 박사과정(정원 6명) 신설 인가를 받다. |
| 2002 | 08.26. | 평생교육원을 개설하다. |
| 2001 | 03.06. | 제 6대 총장에 박형용 박사가 취임하고, 신복윤 박사를 명예 총장에 추대하다. |
| 1999 | 04.15. | Th.M. 과정(정원 10명) 신설 인가를 받다. |
| 1998 | 02.02. | 생활관 옆 부지 (28,463㎥)를 교육용지로 매입하다. |
| 1997 | 03.04. | 제 5대 학장에 신복윤 박사가 취임하다. |
| 11.10. | 교명을 합동신학대학원대학교로 변경하다. | |
| 1996 | 12.11. | 교육부로부터 합동신학대학원대학으로 전문대학원 승격 인가를 받다. |
| 1994 | 03.02. | 본관 건물(2,598 ㎥) 에 4층 (1,065 ㎥)을 증축하다. |
| 1993 | 04.16. | 제 4대 교장에 윤영탁 박사가 취임하다. |
| 12.08. | 정암신학연구소와 칼빈사상연구소를 설립하다. | |
| 1990 | 09.14. | 생활관(3,635㎡)을 개관하다. |
| 1989 | 04.18. | 제 3대 교장에 김명혁 박사가 취임하고, 신복윤 박사를 명예교장에 추대하다. |
| 11.06.-07. | 제 1회 정암신학강좌를 개최하다. | |
| 1987 | 12.09. | 교육부로부터 목회학과(40명) 신설인가를 받다. |
| 1985 | 03.05. | 제 2대 교장에 신복윤 박사가 취임하고, 박윤선 박사를 명예교장에 추대하다. |
| 04.20. | 본관건물 (2,598㎡)을 완공한 후 준공예배를 드리다. | |
| 1984 | 12.21. | 교육부로부터 신학과(40명) 신설인가를 받다. |
| 1983 | 09.09. | 교육부로부터 학교법인 "자유학원"의 인가를 받다. |
| 1982 | 04.30. | 교육부로부터 신학교 설립계획 승인을 받다. |
| 11.09. | 수원시 원천동산 42-3 소재 학교부지(75,085㎡)를 매입하다. | |
| 1981 | 02.24. | 제 1회 졸업식이 남서울교회당에서 거행되고 48명이 졸업하다. |
| 1980 | 11.11. | 바른신학, 바른교회, 바른생활을 이념으로 하여 참신한 혁주의적 신앙운동과 생활운동을 펴 나아갈 것을 염원 하면서 서울시 강남구 반포동 271-45 소재 남서울교회에서 합동신학원을 개교하다. |
| 11.18. | 합동신학원 초대원장에 박윤선 박사가 취임하다. |
